Pondok Pesantren merupakan sebuah lembaga pendidikan yang mengutamakan keterpaduan dimensi Iman, Ilmu dan Amal. Diharapkan dengan system ini dapat terciptanya generasi tangguh, berwawasan luas dan mempunyai kepedulian yang tinggi terhadap kemajuan bangsa. Pondok Pesantren Mubarokul Ulum yang berdiri pada awal tahun 2005, saat ini telah mengimplementasikan cita-cita luhur tersebut dengan pendidikan SMP dan SMA Terpadu yang merupakan perpaduan antara kurikulum Pondok Pesantren Salafiah, Pondok Pesantren Modern Gontor dan Kurikulum Pendidikan Nasional. Kurikulum Pondok Salafiah terkosentrasikan pada kajian keagamaan / kitab kuning serta diwarnai pembiasaan kesalihan dalam kehidupan sehari-hari yang diwarnai dengan kesederhanaan dan kemandirian, sementara kurikulum Pondok Pesantren Modern Gontor terkosentrasikan pada penguasaan Bahasa Asing (Bahasa Arab dan Bahasa Inggris) dan penanaman wawasan berpikir